При аэробном культивировании основным метаболическим процессом обеспечивающим культуру энергией является аэробное дыхание, общая формула которого выглядит следующим образом:
Выделение значительных количеств СО2 требует эффективной системы вентиляции ферментера/биореактора, которая в свою очередь, должна гарантировать сохранение стерильности всего процесса.